Дай на агента си умения

Описва как да използвате Adaptyv Bio Foundry API и Python SDK за проектиране, подаване и извличане на резултати от протеинови експерименти. Използвайте това умение, когато потребителят споменава Adaptyv, Foundry API, анализи за свързване на протеини, експерименти за скрининг на протеини, BLI/SPR анализи, анализи за термостабилност или иска да подаде протеинови последователности за експериментална характеристика. Активирайте го и когато кодът импортира `adaptyv`, `adaptyv_sdk` или `FoundryClient`, или препраща към `foundry-api-public.adaptyvbio.com`.

Използвай умението за симулации на динамика на флуиди с Python, включително уравнения на Навие-Стокс, плитки водни уравнения, стратифицирани потоци, или при анализ на турбулентност, динамика на вихри и геофизични потоци. Поддържа псевдоспектрални методи с FFT, HPC и цялостен анализ на резултатите.

Използвай умението за дистанционно наблюдение, ГИС, пространствен анализ, машинно обучение за наблюдение на Земята и над 30 научни области. Поддържа обработка на сателитни изображения, векторни и растерни данни, пространствена статистика, обработка на облаци от точки, мрежов анализ и облачно-базирани работни процеси.

Използвай умението при работа с геномни региони, BED файлове, покривни тракове, откриване на припокривания, токенизация за ML модели или фрагментен анализ в изчислителната геномика и приложенията за машинно обучение.

Използвай умението, когато искаш систематично да изследваш хипотези за модели в емпирични данни (напр. откриване на измама, анализ на съдържание). Комбинира прозрения от литературата с управлявано от данни тестване на хипотези.

Използвай умението, когато имаш експериментални наблюдения или данни и трябва да формулираш проверими хипотези с предсказания, да предложиш механизми и да проектираш експерименти за тяхното тестване. Следва рамката на научния метод.

Извършвайте високопроизводителни операции с геномни интервали и I/O на биоинформатични файлове върху Polars DataFrames. Подходящо е за припокриване, намиране на най-близки, сливане, покритие, допълване и изваждане на BED/VCF/BAM/GFF интервали.

Създавайте изследователски постери, използвайки HTML/CSS, които могат да бъдат експортирани в PDF или PPTX. Използвайте това умение САМО когато потребителят изрично поиска формат на постер в PowerPoint/PPTX.

Използвайте тази рамка за обучение с подсилване, когато е необходимо бързо паралелно обучение, векторизирани среди, многоагентни системи или интеграция с игрови среди, постигайки 2-10 пъти по-висока скорост.

Извършвайте диференциален анализ на генна експресия (Python DESeq2) за идентифициране на DE гени от RNA-seq данни, Wald тестове, FDR корекция и генериране на вулкан/MA графики.